皇朝墩遗址位于衢江区莲花镇。该遗址于2021年被发现，2022年底进行全面勘探。此后，经过省文物考古研究所抢救性考古发掘，取得重要成果。2024年9月13日，国家文物局通报了皇朝墩遗址考古发掘成果。

遗址内台地与壕沟经历过多次修整，形成较为明确的互动关系，且遗址台地及环壕中的上山文化与跨湖桥文化层位联系极为紧密，器物演化有较强的一致性，为探讨两种文化关系提供了新材料。

在此还发现了世界最早的水稻田。通过对环壕东侧低洼区域钻探和植硅体分析，发现了高密度的水稻植硅体，证实了上山至跨湖桥文化时期已存在大规模的水稻种植行为。也是上山文化中晚期至跨湖桥文化时期水稻田的首次发现，刷新了学术界对史前稻田和稻作农业发展的认知，完善了上山文化稻作农业起源证据链，有力证明了上山文化在世界稻作农业起源和发展中的重要地位，对上山文化遗址群申报世界文化遗产意义非凡。